在SNP分型实验中，选择正确的技术平台是成功的一半。面对琳琅满目的技术方法，为何我们最终聚焦于PCR-LDR和基于二代测序的Hi-SNP这两大平台，并为您提供专项服务？答案的核心在于：摒弃“万能"的幻想，追求相应的匹配。

一、中低通量研究的利器：PCR-LDR SNP分型服务

核心原理：多重PCR扩增→连接酶区分SNP（探针仅匹配时连接）→毛细管电泳

适用场景：项目需要检测的SNP位点较少，样本量在几十例。典型应用包括：药物基因组学核心位点验证、特定通路关键基因多态性筛查、临床诊断标志物确认等。

翼和技术优势：

准确性：自主知识产权的多重PCR为基础，依靠DNA连接酶对碱基错配的敏感性，使其LDR分型准确性远超常规PCR方法，结果可靠，可用于发表高水平论文和临床报告。

灵活性：可根据需求灵活设计引物，扩增目标片段，进行检测。当您的研究焦点明确时，无需为整个基因组付费。单次操作可处理几个到上百个样本（全自动测序仪一般有8、16、48或96根毛细管，自动上样）；单次实验可检测多达20位点的基因型。

成本效益：对于中低通量项目，该平台在试剂和设备上的投入远低于高通量测序，为您节约宝贵的科研经费。

二、高通量研究的引擎：基于二代测序的Hi-SNP分型服务

核心原理：对捕获区域进行深度测序，比对识别SNP

适用场景：项目规模宏大，需要检测的SNP位点较多，样本量大。典型应用包括：全基因组关联分析、群体遗传学研究、多基因风险评分模型构建等。

翼和技术优势：

高通量：SNP位点30-500个之间，数百数千样本推荐使用，一次实验即可获得海量数据，这是任何传统技术都没有的规模优势。平均测序深度1000倍。

“一举多得"的数据产出：不仅能够对已知的SNP进行分型，还能对SNP位点以及周围序列进行测序，在分析中发现新的、稀有的遗传变异，极大拓展了研究的深度和广度。

规模化下的低单点成本：当位点和样本数量足够大时，每个数据点的成本具备竞争力且保持高检出率和高准确率。

三、为何我们专注于此双平台战略？——对其他方法的专业取舍

我们之所以集中资源优化这两个平台，是基于对技术优劣和客户需求的深刻理解。以下是我们不将其他方法作为主力服务平台的核心理由：

等位基因特异性PCR：利用PCR引物3’末端的特异性。通量极低，假阳性率高，标准化难。因为实验设计简单、成本低，适合实验室内部验证个别位点，但难以实现多位点、多样本的高效、标准化检测，不适合作为商业化服务，一些低频位点快速筛查可以使用。

PCR-RFLP：利用限制性内切酶对特定序列的切割能力。流程繁琐，通量低，自动化程度低，假阳性率高。依赖酶切位点。需要凝胶电泳，步骤多、耗时长，易引入人为误差，无法满足现代科研对效率和规模的要求，只有在预算极其有限，且对灵敏度要求不高的情况下，可以作为最初步的、非结论性的筛查工具。

TaqMan探针法：基于PCR的荧光探针水解与荧光信号检测。成本与通量的尴尬区，在性价比和灵活性上被LDR和Hi-SNP双向“夹击"。优势是操作简单、单样本单点位快速检测，但通量极低，无法同时检测多点位。适用于单点位验证。

基因芯片：将探针固定在芯片上，捕获样本DNA。灵活性差，信息量固定。芯片位点是预先设定的，无法自由改变。其检测范围限于已知变异，无法发现新位点。对于非标准定制需求，芯片成本高昂，通常需要专业公司服务。通常用于遗传病筛查等方向，Hi-SNP则在通量和灵活性上全面超越。

总结

如果您的研究是“精准针对"：目标明确，SNP位点和样本量较少，请选择我们的PCR-LDR服务平台，进行精准、可靠的验证。它为您提供了最佳的成本控制、高准确性和快速的交付周期。

如果您的研究是“全景扫描"：需要在大规模群体中筛选海量的遗传标记，或是探索未知，请选择我们的Hi-SNP（NGS）服务平台。它将为您打开一扇通往大数据研究的大门。