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    细胞系STR鉴定资料

    发布时间: 2023-11-09  点击次数: 533次

    一、什么是细胞系

    初代培养物开始次传代培养后的细胞,即称之为细胞系。如细胞系的生存期有限,则称之为有限细胞系(Finite Cell Line);已获无限繁殖能力能持续生存的细胞系,称连续细胞系或无限细胞系 ( I n f i n i t e C e l l L i n e ) 。

    二、介绍

    细胞系缺少系统命名的标准,导致了细胞系的错误鉴定,交叉污染以及缺乏注释等问题。

    三、细胞生物学研究状况

    细胞系作为正常或肿瘤组织的模式细胞被广泛应用于科学研究和药物开发,然而很大一部分的细胞系被错误标记或被其它个体、组织、种系来源的细胞所替代 。

    在细胞生物学领域,文章一直在发表,科研成果一直在公布,但是当中哺乳动物细胞被错误鉴定,存在交叉污染的情况也同时存在着。

    2010年《国际癌症杂志》(IJC)统计出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在细胞被

    Hela细胞污染的情况。

    建立的大鼠(rat)视网膜神经节的细胞系,命名为RGC-5。在随后的十几年时间里,至少230篇论文的研究与假设是建立在这株细胞系上。结果在2009年,序列测定结果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)细胞。

    四、细胞系交叉污染

    五、细胞交叉污染来源

    1. 通过其他实验室馈赠获得细胞系

    2. 细胞系的长时间连续培养

    3. 使用滋养层细胞

    4. 培养瓶的错误标记

    5. 同时操作多种细胞系

    6. 多种细胞系公共使用同一培养基

    7. CO2培养箱


    细胞错误鉴定的后果

    1. 细胞系的损失

    2. 时间和金钱的损失

    3. 在公众领域(文献等)提供错误信息

    4. 造成实验结果不一致或不可重复

    5. 个人:尴尬;公众:羞辱


    如何减少细胞系交叉污染

    1. 从信誉良好的组织或机构获得细胞系

    2. 良好的文档编制方法

    3. 训练有素的技术操作员

    4. 每种细胞系单独使用培养基

    5. 溶液或试剂分装使用

    6.常规性地注意细胞系身份以及其特性是否发生污染

    7.早期做好充足的冻存储备

    8.细胞培养代数不要太高



    何时需做细胞系鉴定

    1、发表文章或申请课题经费前;

    2、使用细胞进行临床治疗(试验)前;

    3、准备冻存保种或已冻存多年的细胞;

    4、一个涉及到细胞试验项目开始/结束时;

    5、新得到的细胞或实验室培养5代以上的细胞;

    6、细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大;


    已开始要求细胞系鉴定的期刊

    Cell

    Nature;

    Bio Techniques;

    Cancer Research;

    Cancer Discovery;

    Clinical Cancer Research;

    Molecular Cancer Research;

    Cancer Prevention Research;

    International Journal of Cancer;

    Molecular Cancer Therapeutics;

    Cell Biochemistry and Biophysics;

    Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention;

    In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal

    六、细胞系的鉴定方法

    1)鉴定细胞的种系来源:常用方法主要有染色体分析、同工酶分析(乳酸脱氢酶,嘌呤核苷磷酸化酶,葡萄糖-6-磷酸脱氢酶,苹果酸脱氢酶等)、DNA指纹图谱等技术。

    2)鉴定细胞的组织来源:可通过形态学手段(上皮细胞样 ,成纤维细胞样 ,淋巴母细胞样等 )、检测组织特异性抗原等进行鉴定。

    3)细胞是否发生转化和恶变:主要通过核型分析、细胞生长行为观 察(是否丧失接触抑制)等进行鉴定。

    4)细胞有无发生交叉污染:主要通过同工酶及DNA指纹图谱技术进行鉴定。

    七、不同细胞鉴定技术比较细胞系鉴定与STR

    STR(Short TandemRepeat,短串联重复序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等机构作为金标准应用于细胞鉴定 。

    细胞STR数据库

    美国的ATCC 细胞库

    德国的DSMZ细胞库

    日本的RIKEN细胞库

    日本的JCRB细胞库

    STR位点数分辨率比较

    细胞系鉴定服务

    为了进一步提高鉴定的分辨率,除了包含ATCC检测的8个STR和1个性别决定位点Amelogenin外,另新增了11个高度多态性位点 ,共检测20个STR位点。