SNP(单核苷酸多态性),指的是在基因组的某一特定位置上,由单个碱基的变异所形成的DNA序列差异。这些变异可以在整个人群中广泛存在,表现为两种或多种不同的核苷酸(腺嘌呤A、鸟嘌呤G、胞嘧啶C、胸腺嘧啶T)出现在该位置的概率高于1%,并且在群体中至少有两种碱基数目的频率超过1%。SNPs的主要类型依据变异的方式和效应,大致可分为以下几种:
1、转换:这是常见的SNP类型,指嘌呤替换嘌呤(A←→G或C←→T)或是嘧啶替换嘧啶(C←→T或A←→T)的情况。这类变异较为保守,因为它们只在同一类核酸之间互换。
2、颠换:相对于转换,颠换指的是嘌呤和嘧啶间的交换(例如A←→C,G←→T,或其他非同类碱基互换)。这类变异较转换少见,但由于改变了碱基的基本分类,可能会引起较大的蛋白质编码改变。
3、同义突变:发生在一个编码区内的SNP,但是由于密码子冗余性,这一改变不会导致氨基酸序列的变化。这类SNP对蛋白质结构和功能的影响较小。
4、错义突变:变异发生在编码区,导致转录后的mRNA翻译出不同的氨基酸,进而可能改变蛋白质的结构和/或功能,有时会直接影响疾病易感性。
5、终止密码子突变:变异导致提前出现或消失的终止密码子,使蛋白质合成过早停止或延后,产生截短或延伸的异常蛋白。
6、剪接位点变异:发生在基因内含子与外显子交界处的SNP,影响mRNA剪接过程,可能导致异常蛋白质生成。
7、调控区SNP:不在编码区内,而是位于启动子、增强子、沉默子等调控元件中,影响基因表达水平,间接影响蛋白质产量。
8、插入/缺失SNP:严格意义上的SNP定义并不包括碱基对的插入或删除,但在某些文献中也将涉及单个碱基的插入或缺失归入SNP范畴讨论,称为InDel,这类变异同样可能对基因功能产生影响。
这些不同类型SNPs的存在使得个体间的遗传多样性得以维持,同时也为疾病的遗传学研究、个性化医疗、种族演化史解读等方面提供了丰富的素材。随着基因组学的深入研究,我们将不断揭开SNP背后隐藏的生命秘密,为人类健康和社会发展作出贡献。