在生物医学研究中,实验大小鼠的遗传纯度是确保数据可重复性与科学有效性的生命线。随着基因编辑、人源化模型及多中心合作研究的普及,遗传背景混淆、亚系误用或种群漂变等问题日益突出。因此,在开展
大小鼠遗传背景鉴定时,必须严格遵循规范流程,规避常见误区。以下六大注意事项,是保障鉴定结果准确可靠的关键。
一、明确鉴定目的,选择合适大小鼠遗传背景鉴定技术
近交系品系确认(如C57BL/6vsBALB/c):推荐使用SNP分型(≥96个位点),精准度高;
亚系区分(如C57BL/6JvsC57BL/6N):必须包含Nnt、Cd5等已知差异位点;
封闭群遗传多样性监测(如SD大鼠):可结合微卫星(STR)与SNP评估杂合度;
避免仅依赖毛色、体重等表型特征——易受环境干扰,无法反映真实基因型。
二、规范采样,杜绝交叉污染
采样部位:尾尖(2–3mm)、耳缘或口腔拭子,避免血液污染其他样本;
工具消毒:每只动物更换剪刀或火焰灭菌,防止DNA残留;
样本标识:立即贴编号标签,同步录入电子系统,杜绝人工记录错误。
三、关注样本质量与保存
新鲜组织优先:冷冻或干燥保存,避免反复冻融;
DNA提取质量:浓度>20ng/μL,OD260/280比值1.8–2.0,确保PCR扩增成功率;
禁止使用降解严重或含PCR抑制物(如粪便、垫料污染)的样本。
四、选择数据库比对
比对参考应来自资源库,如:
小鼠:JacksonLaboratory(JAX)、EMMA、MMRRC;
大鼠:RGD(RatGenomeDatabase);
警惕实验室自建数据库偏差——若无标准品系对照,结果不可靠。
五、警惕“假一致”陷阱
仅检测少数位点(如<20个SNP)可能因巧合匹配而误判;
同源品系混淆:如DBA/1与DBA/2在部分位点相似,需全谱系覆盖;
建议采用商业化标准试剂盒(如CharlesRiver’sSNPPanel、Transnetyx系统),经验证覆盖关键鉴别位点。
六、建立全流程质控体系
设置阳性(已知品系)与阴性(无模板)对照;
鉴定报告应包含原始数据、位点列表、匹配概率及置信度;
定期参与能力验证(如FELASA认证实验室间比对);
禁止仅凭供应商证书替代实际检测——引种后必须复核。